Architektura programu Matrix Manager typu główny-dodatkowy pozwala chronić transmisję danych za pośrednictwem wbudowanych czynników nadmiarowych, obejmujących automatyczną kopię zapasową serwera głównego i dodatkowego oraz urządzeń oprócz aktualizacji bazy danych w czasie rzeczywistym. Nadmiarowość pozwala zagwarantować, że w przypadku awarii któregokolwiek z serwerów Matrix Manager, system wciąż będzie działał, ponieważ nadmiarowy serwer dodatkowy będzie utrzymywał wszystkie wymagane usługi do czasu uruchomienia serwera głównego.